【科研绘图系列】R语言在海洋生态学数据可视化中的应用:以浮游植物叶绿素和初级生产力为例
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文章目录
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- 介绍
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- 数据准备
- 数据处理
- 叶绿素含量(Chl:C)随年龄的变化
- 初级生产力(NPP)随年龄的变化
- 数据可视化
- 加载R包
- 数据下载
- 导入数据
- 数据预处理
- 画图
- 保持图片
- 总结
- 系统信息
介绍
本教材旨在通过R语言及其强大的数据处理和可视化包,展示如何对海洋生态学数据进行分析和可视化。海洋生态学研究中,浮游植物的叶绿素含量(Chlorophyll:C,简称Chl:C)和初级生产力(Net Primary Product,简称NPP)是两个关键的生态指标。它们不仅反映了浮游植物的生理状态,还与海洋生态系统的健康密切相关。本教材将通过实际数据,展示如何使用R语言处理和可视化这些数据,以揭示浮游植物在不同季节和年龄阶段的变化规律。
数据准备
在开始分析之前,我们需要加载相关的数据集。这些数据集包含了浮游植物的叶绿素含量、初级生产力、光照强度(PAR)、季节信息以及其他相关的环境变量。数据集分别存储在不同的CSV文件中,我们将使用read_csv
函数从指定路径加载这些数据。
数据处理
数据加载完成后,我们需要对数据进行预处理。首先,我们筛选出季节为春季和夏季的数据,并去除标记为无效的数据。然后,我们对叶绿素含量(Chl:C)和初级生产力(NPP)进行分组统计,计算每个年龄阶段的平均值和标准差。这些统计结果将用于后续的可视化分析。