课前准备--基因组（WGS/WES）联合单细胞获取突变信息
作者，Evil Genius
还是希望大家在单细胞的基础上往前多走一步。
今天我们来实现目标
严格实现这个目标，需要2个组学的数据，WGS/WES和单细胞数据（示例是单细胞核转录组）。
当然了，都需要bam文件的内容。
之前介绍过cellsnplite的方法，今天我们来更新一个方法。
第一步，检测WES/WGS的突变信息，这个关于基因组的全流程代码，包括SNV + ANNOVAR + MSI + Fusion + CNV + TMB ，课上我会发给大家,大家根据自己的情况进行调整，各种数据库需要大家自己补充了，供大家参考。
主要获取突变信息文件
第二步，分析单细胞的突变信息，获取单细胞级别的突变数据。
代码也很简单
bin/scReadCounts -r 单细胞bam文件 -s 基因组的突变信息文件(vcf格式) -G STARsolo -b Barcode文件 -o 单细胞突变信息矩阵
输出文件
这样，就拿到了单细胞级别的突变信息了。
第三步，就是注释，突变信息的注释，包括引起氨基酸的变化，数据库标注是否有害等等，注释的数据库有很多，课程会列举主要的出来。
最后就是突变信息的单细胞展示了，直接绘图即可。
