MCV的安装和运行

25年5月27日拿到了MCV的代码和运行说明，我来按照这个说明安装和运行一下这个模式。

主要是按照下面的这个网站的说明进行的MCV学习笔记 — mcv-notes 0.1 文档

1.环境变量设置

vim ~/.bashrc

module load netcdf_no_pnetcdf/4.8.1/intel
module load jasper/1.900.19/intel 
module load libpng/1.6.39/intel
module load cmake/3.25.3/gnu
module load pnetcdf/1.12.3/intelexport NCEPLIBS_DIR=/g5/jiangqg/share/NCEPlibs 
export PNETCDF=/g1/app/mathlib/pnetcdf/1.12.3/intel

 2.MCV静态数据

在~/.bashrc 中添加

#静态数据目录
export FIX_DATA=/g5/jiangqg/share/FIX_DATA

3.源代码准备

MCV的代码似乎不是完全公开的，这个只能自己想办法要了。

我从giteadmin/MCV: MCV模式源代码仓库 - MCV - Gitea: Git with a cup of tea

下载了一个然后上传到我的超算上。解压之后可以看到mcv目录下有下面几个文件夹和一个主文件。

ccpl_dp_coupling IO parallel share dynamics main.F90 physics 

可是这样下载的是不全的，于是我采用git命令行的方式，将代码拷贝到我的机器上。

然后我就有了一个CCPL_PMCV的文件夹，里面有全部的代码了。再进行具体工作之前，我需要先把模式；跑起来。

 

4.MPS安装和运行

由于在mcv主模式的运行之前需要MPS,所以先来进行MPS的安装。

首先是获得代码

git clone --recursive https://github.com/DwyaneChou/MPS.gitgit clone http://10.28.30.184:3000/zhoull/MPS.git

通过这两个命令之一，因为一个是github ，一个是内网。获得MPS的代码

然后开始安装

 cd buildFC=ifort CC=icc cmake ..

然后会生成这几个文件

 

make -j 8

会生成好几个可执行文件。

 cd ../runln -sf ../build/*.exe .

这一步把可执行文件移到run文件夹下面

然后开始运行MPS

# 进入MPS根目录cd MPS# 链接MPS所需静态数据到运行目录下ln -sf $FIX_DATA/source_data .# 进入MPS运行目录cd run# 编辑namelist.input文件# 执行gengeo程序生成MCV网格和地形文件mcv_geog.nc./gengeo.exe# 链接GRIB文件，生成GRIBFILE.XXX文件
# NCEP GFS测试数据示例./link_grib.csh FIX_DATA/source_data/met_data/NCEP_GFS/2022081000/gfs.t00z.pgrb2.0p50.f000# 解码GRIB文件，生成FILE:YYYY-MM-DD_HH的二进制文件./ungrib.exe# 进行变量场水平插值，生成mcv_met_YYYYMMDDhhmmss.nc./interpmet.exe# 进行变量场垂向插值，生成最终MCV驱动场mcv_input_$YYYYMMDDhhmmss.nc（区域版本同时生成侧边界条件数据）./realdata.exe

 ./ungrib.exe 成功

 

./interpmet.exe的时候又出现了问题，是怎么回事

可能这个时次的文件没有问题

 最后再运行这个可执行文件./realdata.exe

最终成功得到了我们想要的数据文件，这样前处理应该是成功了的。

我们也可以看到这里面的过程非常类似于之前的WRF模式，那时候WRF的前处理系统叫WPS.

 5.MCV模式安装

这里把CCPL_PMCV作为根目录，然后进到PMCV路径下

CCPL_PMCV/Experiments/PMCV

然后运行下设置环境的脚本。 

source setenv.sh

然后修改一下wckey,这是气象局新超算上的一个神奇的代号，

vim config/common/machine/generic_linux/submit.sbatch.generic_linux

在里面80行，修改一下wckey为自己的。

然后就是准备和编译

 ./configure./clean all./compile

但是我果然出错了，

/g5/mayb/CCPL_PMCV/model_platform/scripts/utils/configure_system: line 856: /g5/mayb/CCPL_PMCV/Experiments/PMCV/config/common/reprod

ucibility/input_data_list: No such file or directory

Recording the version of compilers used ... done

fatal: ambiguous argument 'origin/master': unknown revision or path not in the working tree.

Use '--' to separate paths from revisions, like this:

'git [...] -- [...]'

Archiving this configuration into PMCV.config.20250604-043943.nochecksum.tar ... done

 看起来说的是缺少文件或者文件夹。我猜是因为前面的MPS没有弄好，MPS是预处理部分，专门准备模式需要的数据的。

所以在此之前需要加一个步骤就是MPS安装。

 好，我安装好了MPS，现在继续回来进行MCV的安装和运行。

/g5/mayb/MCV_PUBLIC/CCPL_PMCV/model_platform/scripts/utils/configure_system: line 856: /g5/mayb/MCV_PUBLIC/CCPL_PMCV/Experiments/PMC

V/config/common/reproducibility/input_data_list: No such file or directory

还是出现了这个问题。

到了今天结束，依然还是困于这个问题 。不过还是能够编译，不知能否成功

不过好在的是

似乎是编译成功了！！！

那么接下来就是运行MCV了。

6.MCV模式运行

昨天搞好了安装，今天开始运行。

首先是数据的准备

cp mcv_input_20220810000000.nc ../../CCPL_PMCV/Experiments/PMCV/r
un/atm/MCV/data/

这些复制的命令行真的太长了，之后得想想办法。

然后运行链接的脚本的时候感觉很多的文件都没链接对，是FIX_DATA的文件夹中没有相应的文件。

原来这些文件在/g5/jiangqg/share/FIX_DATA/v16.1.5/fix_am中

这下终于搞对了。

什么叫自由度为1度，看不懂。应该是分辨率为1度吧

env_run.xml 类似于cesm 的设置文件

 

 

 我建立了一个脚本，然后提交，结果运行不到一小会就断了，

这是什么情况呢？

从网上查了一下，是mpi运行时候的问题，和内存有关系，内存越界或者是内存不够的原因。

我尝试调整并行节点数，384 768 等等都不行，而且我发现我不能用太多的节点，30个节点都不行，然后我尝试改内存，500G不行，但是400G可以，然而这些都不是产生这个问题的原因。依然还是会出现这个问题。

 

当我用60节点的时候，出现了一个新的问题，但是如果节点少点就没有这个问题。这些问题都和并行有关系。

这是mcv安装运行的全部步骤了。之后看解决了这个报错问题再更新。