【科研绘图系列】R语言在DOM再矿化数据分析与可视化中的应用
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文章目录
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- 介绍
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- 数据加载与预处理
- 数据总结与计算
- 数据子集与合并
- 数据总结
- 数据可视化
- 加载R包
- 数据下载
- 导入数据
- 数据预处理
- 画图
- 画图2
- 总结
- 系统信息
介绍
本教材通过R语言及其相关包,展示了如何处理和可视化DOM(溶解性有机物)再矿化数据。DOM再矿化是指溶解性有机物在微生物作用下分解为无机物的过程,这一过程在生态系统中具有重要意义。通过分析DOM的再矿化数据,我们可以了解不同处理条件下DOM的分解速率和稳定性,从而为生态学研究提供重要依据。
数据加载与预处理
首先,我们使用read_csv
函数从指定路径加载DOM再矿化数据。数据文件DOM_remineralization.csv
包含多个变量,如DOC_uMC
(溶解性有机碳浓度)、treatment
(处理类型)、timepoint
(时间点)等。加载数据后,我们使用filter
函数去除DOC_uMC
为NA
的行,以确保数据的完整性。
数据总结与计算
接下来,我们对数据进行总结和计算。首先,计算每个处理组相对于对照组的DOC浓度变化(DOC_amended
),并计算其标准差(DOC