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在线绘制Cell Metabolism同款多组配对连线散点图

导读:《Cell Metabolism》文章“A key role of PIEZO2 mechanosensitive ion channel in adipose sensory innervation”fig 2E的多组配对连线散点图展示了iWAT中5个感兴趣基因(Ucp1、Cidea、Fasn、Acacb、Adrb3)的相对表达水平。左侧灰色为Cre-组,右侧蓝色为Cre+组,共12个样品,每个样品以直线连接Cre-样品和Cre+样品。从图中可以直观地看出Cre+组的基因表达水平相对较高,并且显著(校正p均小于0.05)

1打开作图URL

微生信-在线绘制多组左右配对连线散点图

2,示例数据

点击图片上方的示例数据,下载,并使用excel打开。

示例数据包括3列:

第1列是组名,即X轴的名字

第2列是左侧数据的数值,最常见的是基因的表达值

第3列是右侧数据的数值,最常见的是基因的表达值

注:各组间样品数可以不同

3,输入检查

示例数据:点击输入框下面的“示例”按钮,将载入示例数据。

真实数据:数据放在excel中,调整好后,Ctrl+A选中数据,Ctrl+C拷贝,Ctrl+V粘贴数据到输入框中。

然后使用输入框下面的“输入检查”按钮先对输入数据进行检查。若检查不通过,请根据检查提示重复【修改-输入检查】步骤,直到检查通过(如下图所示),然后可以继续选择参数。

注:输入检查按钮会根据不同模块的输入要求,逐行逐列检查输入数据,并给出提示,确保数据符合模块输入要求。

4,选择参数

图片大小:设置了图片的宽度,图片的高度

文字字体大小:设置了轴刻度文字字体大小(即X轴的组名,Y轴的刻度值);Y轴说明文字字体大小;图例字体大小;图例Y的相对位置(越大越靠上);P值字体大小。

颜色:设置了左侧点的填充颜色,边颜色;右侧点的填充颜色,边颜色;以及中间连线的颜色。

点和线大小:设置了点的大小;中间连线的宽度

轴:设置了Y轴的说明文字;X轴组名文字的旋转角度,可以避免文字太长而重叠在一起

P值:设置了P值相对位置,越大越靠上;p值小数点位数

P值检验方法:设置了配对t检验和wilcox检验

Marker形状:设置了左侧marker的形状和右侧marker的形状,可以相同也可以不同

字体:设置了期刊杂志中最常用的两种字体:Times New Roman和Arial。如需使用其他字体,可以下载pdf或者svg图片,然后使用acrobat illustrator或者inkscape进行编辑修改

5,提交出图

检查通过,并且参数选好后,点击“提交”按钮,约1s后,会在页面上显示多组配对散点图。我们提供了pdf、svg两种矢量图,png、tiff两种标量图供大家下载使用。可以使用acrobat illustrator或者inkscape软件编辑矢量图,进行组图,调整文字位置,添加说明等操作,以满足个性化需求。

微生信助力高分文章,用户280000+,谷歌学术5000+  

http://www.xdnf.cn/news/285.html

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