每周靶点：TREM2、DLL3及文献分享

本期精选了《阿尔兹海默症治疗靶标TREM2》《小细胞肺癌的治疗靶点DLL3》《哺乳动物细胞中的邻近标记技术-TurboID和split-TurboID》《蛋白互作研究：邻近标记技术》四篇文章。以下为各研究内容的概述：

阿尔兹海默症治疗靶标TREM2

髓样细胞表达的触发受体2（TREM2）是一种免疫球蛋白超家族的跨膜受体，主要在大脑中的小胶质细胞和外周的巨噬细胞上表达。TREM2参与多种生物学功能，细胞成熟、细胞增殖、细胞存活、吞噬作用和炎症调节等。是一个主要的病理诱导的免疫信号中枢，在阿尔兹海默症等神经系统疾病和癌症中发挥重要作用。

小细胞肺癌的治疗靶点DLL3

Delta样配体3（Delta-Like Ligand 3, DLL3）是Delta样配体（Delta-like ligands，DLLs）家族成员之一。它是一种抑制性Notch配体，在小细胞肺癌（SCLC）和其他神经内分泌肿瘤中高表达，而在正常组织中低表达。DLL3的过表达可促进SCLC细胞的生长并增强其迁移和侵袭能力。这使其称为一个有吸引力的肿瘤治疗靶点。

哺乳动物细胞中的邻近标记技术-TurboID和split-TurboID

TurboID是一种工程化的生物素连接酶，它利用ATP将生物素转化为生物素-AMP，这是一种活性中间产物，可共价标记邻近的蛋白质。通过定向进化进行优化，TurboID的活性比之前描述的与生物素连接酶相关的邻近标记方法（如BioID）高得多，从而能够实现更高的时间分辨率和更广泛的应用。split-TurboID由TurboID的两个非活性片段组成，它们可以通过蛋白质-蛋白质相互作用或细胞器-细胞器相互作用重新组装，这有助于提高比单独的全长酶更高的靶向特异性。通过TurboID或split-TurboID进行生物素化的蛋白质随后用链霉亲和素珠进行富集，并通过质谱法进行鉴定。

2020年11月研究人员在Nat Protoc上发表了一篇名为“Proximity labeling in mammalian cells with TurboID and split-TurboID”的文章，这是一篇关于TurboID和split-TurboID在哺乳细胞中邻近标记的protocal。作者概述如何使用实验室最新的PL酶TurboID6和split-TurboID进行亚细胞蛋白质组学图谱的绘制。作者详细描述了如何进行融合结构设计和表征（可变时间），蛋白质组样品制备（5-7d），质谱数据获取（2d）和蛋白质组数据分析（1周）。

蛋白互作研究：邻近标记技术

蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）在生物体功能中发挥重要作用，参与细胞周期调控，信号转导等细胞生物学过程。传统的分析PPI的检测方法有免疫共沉淀（Co-IP）、GST，Pull-Down，但是他们的检测是体外检测，不能真实反应细胞内蛋白质之间的相互作用。而新发展的邻近标记技术（PL）可直接在自然条件下的活细胞内进行，有利于捕获体内瞬时发生或微弱的蛋白互作关系。在蛋白质互作中起作用，在转录组、蛋白质组空间动态及组蛋白修饰上，亚细胞定位，药物靶标的发现也有重要的应用。邻近标记（PL）方法与基于质谱（MS）的定量蛋白质组学相结合已成为表征PPI的有力方法。

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