【科研绘图系列】R语言在海洋生态学中的应用：浮游植物糖类组成与溶解性有机碳的关系
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文章目录
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- 介绍
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- 数据准备
- 数据处理
- 糖类组成随年龄的变化
- 糖类组成与DOC含量的关系
- 数据可视化
- 加载R包
- 数据下载
- 导入数据
- 数据预处理
- 画图
- 总结
- 系统信息
介绍
本教材通过R语言及其强大的数据处理和可视化包，展示如何分析和可视化海洋生态学数据，特别是浮游植物的糖类组成与溶解性有机碳（DOC）的关系。糖类是浮游植物细胞壁的重要组成部分，其组成变化可以反映浮游植物的生理状态和生态适应性。同时，DOC是海洋生态系统中重要的碳库，其含量和变化对海洋生态系统的碳循环具有重要意义。通过R语言，我们可以清晰地展示这些生态指标之间的关系，为海洋生态学研究提供有力支持。
数据准备
在开始分析之前，我们需要加载相关的数据集。这些数据集包含了浮游植物的糖类组成（如岩藻糖、甘露糖等）和溶解性有机碳（DOC）含量，以及季节、年龄等信息。数据集分别存储在不同的CSV文件中，我们将使用read_csv函数从指定路径加载这些数据。
数据处理
数据加载完成后，我们需要对数据进行预处理。首先，我们筛选出春季和夏季的数据，并去除标记为无效的数据。然后，我们将糖类组成的数据从宽格式转换为长格式，以便后续的可视化分析。此外，我们还对DOC含量按年龄、季节和叶片进行分组统计，计算每个组的平均值和标准差。