【科研绘图系列】R语言绘制和弦图（Chord diagram plot）
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文章目录
- 介绍
- 加载R包
- 数据下载
- 导入数据
- 数据预处理
- 相关性计算
- 和弦图
- 系统信息
介绍
本文介绍了一个基于R语言的数据分析和可视化流程，主要用于生成和弦图（Chord Diagram）。和弦图是一种用于展示多个实体之间相互关系的可视化工具，广泛应用于生物信息学、生态学等领域。通过和弦图，可以清晰地展示不同数据集之间的相关性。
数据处理与分析
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数据导入：首先，从本地文件导入两个数据集，分别是代谢物数据（
Metabolites.txt）和环境元素数据（Elements.txt）。这些数据通过read.delim函数读取，并进行初步筛选，去除总和为零的行。 -
相关性计算：将数据转置后，使用
corr.test函数计算相关性，采用Spearman方法，并对p值进行F