服务器中R及Rstudio-server的安装等

一、conda的安装及环境配置

1、conda可以安装miniconda或者anaconda 

$ wget https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
$ bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh   ###运行激活conda

2、之后可以添加不同的channel，创建独立的conda环境例子，以下为我需要配置MAESTRO环境。

$ conda config --add channels defaults
$ conda config --add channels liulab-dfci
$ conda config --add channels bioconda
$ conda config --add channels conda-forge
# To make the installation faster, we recommend using mamba
$ conda install mamba -c conda-forge
$ mamba create -n MAESTRO maestro=1.5.0 -c liulab-dfci
# Activate the environment
$ conda activate MAESTRO  
###在运行MAESTRO时，要先激活环境，之后进入R可以直接library("MAESTRO")，因为MAESTRO不仅是一个环境，也是一个R包，里面有很多函数。

3、一些常见的conda命令

conda --version
# 显示conda 版本
conda info --envs
# 查看当前存在环境
conda create -n your_env_name python=X.X
conda create --name new_name clone old_name
#