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因为gromacs必须安装cuda(系统自带的NVIDIA驱动不行),这里介绍下如何安装cuda

1. 安装步骤
查看是否安装了cuda

# 法1  cat  /usr/local/cuda/version.txt
# 法2    nvcc --version

若没有安装,则查看是否有N卡驱动,若无N卡驱动,则到软件与更新 -> 附加驱动中安装驱动

查看N卡驱动支持的cuda版本

nvidia-smi


如下图支持最高CUDA版本是11.4

2. 到cuda-toolkit-archive,选择需要的CUDA下载CUDA Toolkit 11.4 Downloads | NVIDIA Developer

2.1如下图,选择runfile(local),并使用生成的指令进行下载和安装

2.2若第1步提示Existing package manager installation of the driver found. It is strongly recommended that you remove this before continuing.,选择continue,然后下一步输入accept,再下一步中去除driver项,之后选择install:

2.2.1.选择continue

2.2.2.输入accept

2.2.3.取消Driver、然后选择Install(敲击空格取消Driver)

设置前:

设置后:

3. 在~/.bashrc文件中添加如下环境变量:

export PATH=/usr/local/cuda-11.4/bin${PATH:+:${PATH}}
export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/cuda-11.4/lib64${LD_LIBRARY_PATH:+:${LD_LIBRARY_PATH}}

4.验证是否安装成功

nvcc -V

5、cudnn安装

网址:cuDNN Archive | NVIDIA Developer

cuDNN Archive | NVIDIA Developer

因为cuda是11.8,所以选择对应的cudnn,我选择的8.5

下载 tar格式

tar -xvf cudnn-linux-x86_64-8.5.0.96_cuda11-archive.tar.xz 
sudo cp cuda/include/cudnn*.h /usr/local/cuda/include 
sudo cp -P cuda/lib64/libcudnn* /usr/local/cuda/lib64 
sudo chmod a+r /usr/local/cuda/include/cudnn*.h 


验证:
cat /usr/local/cuda/include/cudnn_version.h | grep CUDNN_MAJOR -A 2

出现以下信息说明安装成功:

http://www.xdnf.cn/news/285769.html

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