在服务器上安装AlphaFold2遇到的问题(2)

如何删除已安装的cuDNN

1. 通过包管理器卸载（推荐）

RHEL/CentOS (dnf/yum)
#查看已安装的 cuDNN 包
sudo dnf list installed | grep cudnn

#卸载 cuDNN 运行时和开发包
sudo dnf remove -y libcudnn* libcudnn8* libcudnn-devel*

Ubuntu/Debian (apt)
#列出已安装的 cuDNN 包
apt list --installed | grep cudnn

#卸载所有 cuDNN 相关包
sudo apt purge -y libcudnn8* libcudnn-dev*

2. 手动安装的 cuDNN 清理

如果通过 .tar 文件手动安装，需删除以下文件：
# 删除头文件
sudo rm -f /usr/local/cuda/include/cudnn*.h

# 删除库文件
sudo rm -f /usr/local/cuda/lib64/libcudnn*

# 清理缓存
sudo ldconfig

3. 残留文件清理

# 检查可能的残留文件
sudo find / -name "*cudnn*" 2>/dev/null

# 删除找到的残留文件（根据实际路径调整）
sudo rm -rf /usr/src/cudnn_samples_*
sudo rm -f /etc/alternatives/libcudnn*

4. 验证卸载

# 检查库文件
ldconfig -p | grep cudnn # 应该无输出

# 检查头文件
ls /usr/local/cuda/include/cudnn.h 2>/dev/null # 应该提示不存在

5. 多版本管理（可选）

如果系统有多个 CUDA 版本，需要明确指定路径清理：
#例如清理 CUDA 12.9 下的 cuDNN
sudo rm -f /usr/local/cuda-12.9/include/cudnn*.h
sudo rm -f /usr/local/cuda-12.9/lib64/libcudnn*

6. Conda 环境中的 cuDNN

如果是通过 Conda 安装：
conda list | grep cudnn # 查看包名
conda remove -n 环境名 cudnn

注意事项
谨慎使用 rm -rf：确保只删除 cuDNN 相关文件
备份重要数据：操作前建议备份 /usr/local/cuda 目录
依赖关系：卸载后依赖 cuDNN 的程序（如 TensorFlow/PyTorch）将无法运行

卸载后建议

如果需要重新安装，建议：
# 安装时指定版本（例如 cuDNN 8.9.7）
sudo dnf install -y libcudnn8-8.9.7.29 libcudnn8-devel-8.9.7.29
通过以上步骤可以彻底清理系统中的 cuDNN。如果遇到权限问题，可在命令前加 sudo。