【染色归一化】staintools工具详讲

staintools工具原代码是没有GPU加速的，代码链接
运行速度较慢，因此，github上有研究者写了pytorch加速版本的staintools
本篇主要讲GPU加速版本的staintools工具的使用教程。

1.背景

目前的公开数据库中的WSI是由不同研究机构制作上传的，这导致WSI有很大的颜色差别，例如：

而颜色的不同会影响深度学习模型的结果，因此，对图片进行染色归一化。

2.staintools工具算法

staintools工具的原理用一句话概括就是：选择一张染色比较成功的图片作为模板，将其他所有图片处理成与模板图片一样的颜色空间。对此，statintools提供了三种算法：Vahadane、Reinhard、Macenko。大家主要用的是Vahadane，我自己没有详细研究这三个算法的区别，我就运行了几例，没有看出太大区别之后，就直接用的Vahadane算法。

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