2025.05.30【转录组】|Ribo-seq数据流程详解（一 质量控制）
Ribo-seq数据流程详解（一 质量控制）
作者：穆易青
文章目录
- Ribo-seq数据流程详解（一 质量控制）
- 1. 前言
- 2. 原始数据质控
- 3. 参数详解
- 4. 总结
1. 前言
Ribo-seq（核糖体测序）主要研究转录后调控和翻译动态。高质量的Ribo-seq数据是可靠生物学结论的基础。本文介绍了Ribo-seq数据分析中的常见质控（QC）方法，并结合Snakemake自动化流程，帮助初学者高效完成Ribo-seq数据的标准质控。
2. 原始数据质控
目的：检查测序原始数据的质量，去除低质量reads和接头污染。
常用工具：fastp
rule ribo_seq_reads_filtering:input